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线粒体基因片段在梭子蟹系统发育及物种鉴定中的应用
线粒体基因片段在梭子蟹系统发育及物种鉴定中的应用
作者:
CUI Zhao-xia
WANG Chun-lin
ZHANG Shu
刘小林
李喜莲
王鸿霞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
线粒体基因
梭子蟹
系统发育
分子分类
摘要:
测定三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)9个个体COI基因部分序列467 bp,7个个体16S rRNA基因部分序列519 bp,同时测定样品蟹1个个体COI基因部分序列468 bp.结合GenBank中收集的梭子蟹科COJ,16S rRNA两个基因所有同源序列信息,使用Kimura双参数模型采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)构建梭子蟹科分子系统发育树;将样品蟹测得的COI基因序列和已知鲟属的其他蟹同源序列(429 bp)进行比对分析.结果分析表明:两个基因片段序列平均碱基AT数量分数都明显高于GC数量分数;梭子蟹属与美青蟹属关系最近,蟳属应为区别于梭子蟹属、美青蟹属、青蟹属的另一支,支持蟳属应划分在短桨蟹亚科的观点;根据遗传距离以及转换/颠换(R)值分析,判定出样品蟳为锐齿蟳.本试验运用线粒体基因片段探讨了梭子蟹类的系统发育关系以及样品蟹的种类鉴定,为线粒体基因片段在梭子蟹的物种鉴定和系统发育重建中的开发和利用提供重要参考.
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青蟹属
线粒体DNA
系统发育
长脚蟹科首个线粒体基因组测定及系统发育分析
短尾次目
长脚蟹科
线粒体基因组
系统进化
非单系性
内容分析
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相关文献总数
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文献信息
篇名
线粒体基因片段在梭子蟹系统发育及物种鉴定中的应用
来源期刊
海洋科学
学科
生物学
关键词
线粒体基因
梭子蟹
系统发育
分子分类
年,卷(期)
2008,(4)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
9-18
页数
10页
分类号
Q178|Q953
字数
6431字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
刘小林
西北农林科技大学动物科技学院
120
1293
18.0
31.0
2
王鸿霞
西北农林科技大学动物科技学院
10
192
7.0
10.0
4
ZHANG Shu
西北农林科技大学动物科技学院
1
9
1.0
1.0
8
李喜莲
中国科学院海洋研究所
1
9
1.0
1.0
9
CUI Zhao-xia
西北农林科技大学动物科技学院
1
9
1.0
1.0
12
WANG Chun-lin
中国科学院海洋研究所
1
9
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节点文献
线粒体基因
梭子蟹
系统发育
分子分类
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
海洋科学
主办单位:
中国科学院海洋研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3096
CN:
37-1151/P
开本:
16开
出版地:
山东省青岛市南海路7号中科院海洋所
邮发代号:
2-655
创刊时间:
1977
语种:
chi
出版文献量(篇)
4831
总下载数(次)
9
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:
The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:
http://www.863.org.cn
项目类型:
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学科类型:
信息技术
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海洋科学2008年第12期
海洋科学2008年第11期
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