广西高致病性 PRRSV Nsp2基因的克隆、序列分析和抗原表位预测

• 作者: 刘加波 唐小飞 庞耀珊 谢丽基 谢志勤 谢芝勋 邓显文
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 Nsp2基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 分类号: S852.659.6|S858.28
• 字数: 2276字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2008.01.001

摘要

根据猪繁殖与吸吸综合征病毒(PRRSV)VR2332 Nsp2基因序列合成特异性引物,对广西分离的高致病性PRRSV进行RT-PCR扩增,将扩增出的796 bp片段插入pMD18-T载体中进行序列测定和分析,并用DNA Star软件对Nsp2基因推导的氨基酸序列进行了表位分析.结果显示,广西3个县、市的PRRSV分离株Nsp2基因第483位和第532位～第560位氨基酸发生缺失,核苷酸序列之间的同源性为97.0%～97.4%,推导编码的氨基酸序列之间的同源性为93.6%～94.7%;与PRRSV VR2332株、MLV株和CH-1a株核苷酸之间的同源性分别为79.0%～79.2%、78.8%～78.9%和88.2%～89.3%;氨基酸之间的同源性分别为59.4%～60.2%、59.4%～60.2%和70.9%～81.6%,表明广西3个县、市的PRRSV分离株Nsp2基因与VR2332株、MLV株和CH-1a株比较变异较大.表位分析表明,由于博白株的Nsp2基因的第532位～560位氨基酸的缺失,与VR2332株比较,其亲水性、抗原指数均发生了大的变化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘加波		118	1407	21.0	29.0
2	谢芝勋		139	1616	23.0	31.0
3	谢志勤		104	1135	18.0	27.0
4	唐小飞		47	671	16.0	23.0
5	庞耀珊		118	1412	21.0	30.0
6	邓显文		118	1428	21.0	30.0
7	谢丽基		73	730	16.0	23.0