马铃薯花青素转录激活基因stwd40的克隆与表达分析

• 作者: 刘仕芸 张树珍 杨本鹏 罗遵喜 蔡文伟
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 马铃薯 花青素转录激活基因 克隆 RT-PCR
• 年，卷（期）: 2008,（9）
• 所属期刊栏目: 蔬菜
• 页码范围: 1317-1322
• 页数: 6页
• 分类号: S532
• 字数: 3170字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0513-353X.2008.09.011

摘要

根据GenBank中报道的茄属植物矮牵牛花青素wd40类转录激活基因an11及番茄wd40基因113964R的mRNA序列的保守区结构,设计简并引物,从紫色马铃薯皮中克隆了马铃薯wd40类转录激活基因的保守片段,再利用RACE技术分别获得了该基因的3'端和5'端.序列分析表明,该基因核苷酸序列为1 292 bp,具有完整的编码框,推导其编码362个氨基酸,命名为stwd40.推测的氨基酸序列与GenBank数据库中大量物种的花青素转录激活蛋白wd40有较高的同源性,其中与矮牵牛花青素转录调控基因an11的相似性达86%.RT-PCR表达分析显示stwd40在紫色马铃薯叶、茎、皮、肉及根中都有表达,其中在茎中的表达量最高,肉中表达量最低;其在白色马铃薯的叶、皮和肉中也有表达,推测该基因为组成型表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨本鹏	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	40	669	13.0	25.0
2	张树珍	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	79	1288	20.0	33.0
3	刘仕芸	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	3	89	2.0	3.0
4	蔡文伟	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	21	218	9.0	14.0
5	罗遵喜	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	3	46	3.0	3.0