中国普通野生稻与栽培稻种SSR多样性的比较分析

• 作者: 吕建珍 张晓丽 彭锁堂 王海岗 袁筱萍 郭辉 魏兴华
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 普通野生稻 栽培稻 地方品种 选育品种 遗传多样性 分子方差分析
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 591-597
• 页数: 7页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0496-3490.2008.04.009

摘要

采用48对SSR引物对288份我国普通野生稻和栽培稻的遗传多样性进行比较分析.结果显示.共检测到505个等位基因,每个位点的等位基因数变幅为5～20,平均10.5个;平均Nei基因多样性指数(He)为0.731,变幅为0.384(RM409)～0.905(RM206).普通野生稻遗传多样性高于栽培稻种,栽培稻等位基因数和平均Nei基因多样性指数分别为普通野生稻的70.2%和88.2%,其中,栽培稻地方品种和选育品种等位基因数分别为普通野生稻的65.4%和53.0%,选育品种等位基因数仅为地方品种的81.1%.AMOVA分析表明,总变异的10.3%是由于种间SSR遗传差异所引起的,不同SSR位点种间的分化程度不同,在0.7%～46.3%之间,有43个位点种间遗传分化达到显著水平,其中以RM427分化最为明显,达46.3%.聚类分析表明,中国普通野生稻总体偏粳,极少数广东、海南材料偏籼.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁筱萍	中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室	27	561	13.0	23.0
2	郭辉		18	169	5.0	13.0
3	吕建珍	中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室	1	64	1.0	1.0