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摘要:
根据剪接位点的核酸序列保守特征,以及邻近位点的碱基组成和关联特性,结合一对可变剪接位点之问的距离参数和受体端剪接位点前30位碱基的GC和TC含量,利用结合多样性指标的二次判别方法(IDQD),预测了人类基因组中可变和组成性内含子的供体端和受体端的剪接位点,对可变的供体端和受体端剪接位点,阈值ξ选择-2时,总的预测精度分别为87.9%和89.9%,对组成性的供体端和受体端剪接位点,阈值ξ选择-1,总的预测精度分别为92.8%和94.3%.
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文献信息
篇名 人类基因组中可变和组成性剪接位点的预测
来源期刊 生物化学与生物物理进展 学科 生物学
关键词 可变剪接 组成性剪接 二次判别方法
年,卷(期) 2008,(10) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 1188-1194
页数 7页 分类号 Q61
字数 5162字 语种 中文
DOI 10.3321/j.issn:1000-3282.2008.10.013
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 晋宏营 内蒙古大学物理科学与技术学院 7 26 3.0 5.0
2 罗辽复 内蒙古大学物理科学与技术学院 101 476 12.0 17.0
3 张利绒 内蒙古大学物理科学与技术学院 28 69 6.0 7.0
4 邢永强 内蒙古大学物理科学与技术学院 4 29 3.0 4.0
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研究主题发展历程
节点文献
可变剪接
组成性剪接
二次判别方法
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物化学与生物物理进展
月刊
1000-3282
11-2161/Q
大16开
北京朝阳区大屯路15号中国科学院生物物理研究所内
2-816
1974
chi
出版文献量(篇)
3726
总下载数(次)
14
相关基金
内蒙古自然科学基金
英文译名:Natural Science Foundation of Neimenggu Province
官方网址:http://www.btsti.com/policy/district/2005-1-27/20051271058235030.htm
项目类型:辽宁省自然科学基金
学科类型:
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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