草棉EST-SSRs的遗传评价

• 作者: 余渝 冯常辉 张献龙 张艳欣 林忠旭 王志伟
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 草棉 表达序列标签 简单序列重复 多态性信息含量 遗传作图
• 年，卷（期）: 2008,（12）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 2085-2091
• 页数: 7页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3721/SP.j.1006.2008.02085

摘要

根据GenBank中公布的247条草棉EST序列,搜索SSR并进行引物设计.其中的25条序列含有27个SSR,1-6碱基重复类型都存在,二碱基和三碱基重复的频率较高.为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性,依据25条序列共设计25对EST-SSR引物,其中22对引物扩增出清晰可辨的DNA条带,产生92个多态性片段,平均每对引物产生3.64个多态性片段.引物的多态性信息含量(PIC)在0.49～0.91之间,平均为0.81.6对引物在BC1种间作图群体[(鄂棉22×Pima3-79)×鄂棉22]中表现多态性,产生7个多态性位点,其中5个为共显性,2个为显性.除HAU230b标记在BC1分离群体中不符合孟德尔式分离比例,其余引物表现正常分离.6个位点被整合到陆地棉和海岛棉种间BC1遗传连锁图谱卜的6条染色体:有4个位于A亚基因组的4条染色体上(Chr.6、10、11和12),2个位于D亚基因组的2条染色体(Chr.19和20).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张献龙	华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室	105	3479	31.0	56.0
2	林忠旭	华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室	16	1156	10.0	16.0
3	王志伟	华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室	3	22	2.0	3.0
4	冯常辉	华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室	2	16	1.0	2.0
5	张艳欣	华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室	2	57	2.0	2.0