EB病毒活化对鼻咽癌基因表达模式的影响

• 作者: 商涛 廖之君 梁爽 郑文岭 陈霞 马文丽
• 来源期刊: 癌症
• 学科: 医学
• 关键词: 鼻咽肿瘤/病因学 EB病毒 复发感染 基因表达谱 差异基因
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 快速报道
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: R318.04
• 字数: 4544字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-467X.2008.01.001

摘要

背景与目的:EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染在鼻咽癌发生中发挥重要作用.本研究的目的在于探讨潜伏的EBV活化后形成的复发感染对鼻咽癌发生过程中全基因组表达的影响.方法:收集EBV阳性(EBV+)/EBV阴性(EBV-)的鼻咽癌靶标基因表达谱和EBV复发感染次数不同的鼻咽癌细胞株基因表达谱,通过生物信息学手段对其进行交叉比较,统计学分析筛选出25个差异基因.运用DAVID(database for annotation,visualization and integrated discovery)、pSTIING(protein,signaling,transcriptional interactions and inflammation networks gateway)、GATHER(gene annotation tool to help explain relationships)和TELiS(transcription element listening system)在线分析工具对25个共同差异基因进行表达模式的预测.结果:与EBV初次感染时的基因表达谱比较,仅有DUSP1、TOP1、HOXA9、DEK、IMPDH2、PABPC1等25个基因在EBV复发感染时仍然呈明显差异表达;这25个差异基因及其相关转录因子主要通过2种模式相互作用:一条主要涉及TOP1、DUSP1、DUSP6和RPS28等,另一条是由PITX1、CD9、HOXA9和IMPDH2组成的转录相关环.结论:EBV潜伏后的复发感染,可能通过筛选到的差异基因的2种表达模式发挥功能,最终导致鼻咽癌的发生.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马文丽	南方医科大学基因工程研究所	275	1255	15.0	23.0
2	郑文岭	南方医科大学基因工程研究所	121	603	11.0	20.0
6	廖之君	南方医科大学基因工程研究所	10	33	4.0	5.0
7	梁爽	南方医科大学基因工程研究所	18	75	5.0	7.0
8	陈霞	南方医科大学基因工程研究所	18	62	4.0	7.0
9	商涛	南方医科大学基因工程研究所	7	15	3.0	3.0