基于NC Ⅲ和TTC设计的胚乳性状QTL区间作图方法

• 作者: 宋雯 徐辰武 汤在祥 王亚民 王学枫
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 胚乳性状 QTL作图 NCIII设计 TTC设计 极大似然估计 EM算法
• 年，卷（期）: 2008,（10）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1734-1743
• 页数: 10页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0496-3490.2008.10.008

摘要

根据三倍体胚乳性状的遗传模型,提出基于NC III以及TTC两种遗传设计的胚乳性状QTL作图新方法,并通过计算机模拟数据,对该方法的可行性和有效性进行了分析验证.模拟研究供试因素包括QTL遗传力、F2群体植株数和每家系混合样品测定的胚乳数.考察指标包括QTL的统计功效以及QTL位置和效应估计的准确度与精确度.结果表明,2种设计均有较高的QTL统计功效,在供试的大多数处理中,即使QTL的遗传力只有5%,其被发现能力也可达100%.两种设计均可有效区分胚乳QTL的各种遗传效应.基于TTC设计的胚乳QTL作图方法,在QTL的统计功效、位置估计和效应估计上,均优于NC IIl设计,虽然这一优势随着QTL遗传力的提高以及样本容量的增大而有降低的趋势.