基于复杂网络理论的PPI网络拓扑分析

• 作者: 李敏 王建新 陈建二
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 生物信息学 蛋白质相互作用网络 复杂网络 网络拓扑
• 年，卷（期）: 2008,（8）
• 所属期刊栏目: 博士论坛
• 页码范围: 20-22,44
• 页数: 4页
• 分类号: TP393
• 字数: 3062字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2008.08.006

摘要

蛋白质相互作用在生命活动中起核心作用,由蛋白质相互作用构成的PPI网络的拓扑特性分析是后基因组时代最重要的研究课题之一.应用复杂网络理论对DIP数据库中7个物种的8个PPI网络的拓扑结构进行分析与研究.分析结果表明,这些PPI网络具有较小的平均路径长度和较高的聚集系数,其度分布服从幂规律,即p(k)=ak',其中r大于1小于3,a近似等于1±0.5,表现出典型的无标度性,并具有高的异质性.其中平均度大于3.5的5个PPI网络对随机删除不超过10%的顶点都具有很好的鲁棒性,但对有选择的删除2%的高度顶点就开始表现出极弱的抗攻击性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王建新	中南大学信息科学与工程学院	371	3185	23.0	39.0
2	陈建二	中南大学信息科学与工程学院	167	1535	20.0	30.0
3	李敏	中南大学信息科学与工程学院	116	690	14.0	20.0