开源软件在化学数据库分子结构检索中的应用

• 作者: 李晓霞 聂峰光 袁小龙 郭力
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 化学
• 关键词: 分子结构检索 开源 CDK JOELib 化合物子结构检索 化学数据库 化学信息学
• 年，卷（期）: 2008,（9）
• 页码范围: 1143-1146
• 页数: 4页
• 分类号: O6-39
• 字数: 2300字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4160.2008.09.022

摘要

分子结构检索是化学数据库必备的检索手段,利用开源化学软件是实现分子结构检索的有效途径.不同于商业软件的解决方案,开源本身就体现了经济性和可重复开发的特点.本文利用Java开源化学软件开发工具包如Chemistry Development Kit(CDK)、JOELib的基本构件,基于JSP+Servlet+Bean+MySQL技术搭建了一个网络化学数据库结构检索平台.其中包括分子全结构和子结构检索,并实现了在线提交分子和化合物结构的三维显示等.对包含12万化合物结构信息的数据库的测试表明,该系统在经过预处理和一系列优化措施下,实现了较好的检索性能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁小龙	中国科学院过程工程研究所多相复杂系统国家重点实验室	16	79	6.0	8.0
2	郭力	中国科学院过程工程研究所多相复杂系统国家重点实验室	59	532	13.0	18.0
3	李晓霞	中国科学院过程工程研究所多相复杂系统国家重点实验室	38	299	11.0	13.0
4	聂峰光	中国科学院过程工程研究所多相复杂系统国家重点实验室	17	123	7.0	10.0