国外栽培豌豆遗传多样性分析及核心种质构建

• 作者: Rebecca Ford Robert R Redden 关建平 刘庆昌 宗绪晓 王述民
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 豌豆栽培种(Pisum sativum L ) SSR 遗传多样性 核心种质 国外资源
• 年，卷（期）: 2008,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1518-1528
• 页数: 11页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0496-3490.2008.09.005

摘要

从111对备选SSR引物中筛选出能扩增出清晰稳定单一带的多态性引物21对及其最佳退火温度,并优化了豌豆SSR标记实验体系.利用上述引物,对来自于67个国家的731份豌豆栽培种质(Pisum sativum L.)进行遗传多样性分析与核心种质构建.共扩增出109条多态性带,每对引物平均扩增出5.19个等位变异.SSR等位变异在各大洲间分布不均匀,有效等位变异数、Shannon's信息指数(I)洲际间差异明显.各大洲资源群间遗传多样性差异显著,其中亚洲最高(I=1.1753),欧洲其次(I=1.1387),俄罗斯联邦(I=1.0285)、美洲(I=1.0196)、非洲(I=0.9254)、大洋洲(I=0.8608)依次降低.利用Popgene 1.32软件.依豌豆栽培资源洲际间Nei78遗传距离可聚类成2个组群和4个亚组群;基于Structure 2.2软件分析,国外栽培豌豆资源实际由3大类群组成,并与Popgene 1.32聚类结果呼应得较好.上述两种分析方法均表明,国外栽培豌豆类群的遗传多样性与其地理分布相关.设计并实践了一套基于Structure分析的科学可靠、逻辑性强的核心种质构建标准化方案,并依此构建了一套以6.57%的资源(48份)涵盖总体84.4%等位变异的国外栽培豌豆核心种质.