基因芯片筛选差异表达基因方法比较

• 作者: 单文娟 施季森 童春发
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因芯片 杨树 差异表达
• 年，卷（期）: 2008,（12）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 1640-1646
• 页数: 7页
• 分类号: Q3
• 字数: 4903字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2008.01640

摘要

使用计算机模拟数据和真实的芯片数据,对8种筛选差异表达基因的方法进行了比较分析,旨在比较不同方法对基因芯片数据的筛选效果.模拟数据分析表明,所使用的8种方法对均匀分布的差异表达基因有很好的识别、检出作用.算法方面,SAM和Wilcoxon秩和检验方法较好;数据分布方面,正态分布的识别效果较好,卡方分布和指数分布的识别效果较差.杨树cDNA芯片分析表明,SAM、Samroc和回归模型方法相近,而Wilcoxon秩和检验方法与它们有较大差异.