microRNA计算发现方法的研究进展

• 作者: 侯妍妍 应晓敏 李伍举
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 医学
• 关键词: microRNA 计算发现 同源搜索 比较基因组学 作用靶标 机器学习
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 687-696
• 页数: 10页
• 分类号: R4
• 字数: 9762字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2008.06.005

摘要

microRNA(miRNA)是近几年发现的一类长度为-21 nt的内源非编码小RNA,在植物和动物中发挥着重要而广泛的调控功能.它的发现主要有cDNA克隆测序和计算发现两条途径.由于cDNA克隆测序方法受miRNA表达的时间和组织特异性以及表达水平的影响,而计算发现可以弥补其不足,因此miRNA的计算发现方法研究受到了广泛的重视.文章对近几年计算发现miRNA的研究进展进行了综述,根据计算发现方法的本质,将计算发现方法归纳为5类,分别是同源片段搜索方法、基于比较基因组学的预测方法、基于序列和结构特征打分的预测方法、结合作用靶标的预测方法和基于机器学习的预测方法,并对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析,最后探讨了进一步的发展方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李伍举	军事医学科学院基础医学研究所计算生物学中心	19	164	5.0	12.0
2	侯妍妍	军事医学科学院基础医学研究所计算生物学中心	2	34	1.0	2.0
3	应晓敏	军事医学科学院基础医学研究所计算生物学中心	14	100	3.0	9.0