鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测

• 作者: 张传生 杜立新 耿立英
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 非翻译区 小RNA 生物信息学 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2008,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1026-1032
• 页数: 7页
• 分类号: S8
• 字数: 3667字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2008.08.013

摘要

GDF-8、IGF-I,IGF-III、IGF2R、,IGFBP2和GHR是鸡的重要经济性状候选基因.利用miRanda和Targetscan软件预测6个基因3'UTR潜在的microRNA靶标,并发掘靶标区域SNP位点.结果表明:在6个基因的26个microRNA靶标区域,共检测到125个SNP位点,在靶标及其5'和3'邻接等长侧翼区分别检测到47个,44个和35个SNPs位点,其中12个SNP定位于靶标种子序列互补区.种子序列互补区及其3'侧翼区的SNP位点可能会影响microRNA的调控,导致家禽的表型变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜立新	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所国家畜禽分子遗传育种中心	110	1652	21.0	37.0