IGS1、ITS和D1/D2区在毛孢子菌鉴定中的意义及国内阿萨希毛孢子菌基因分型研究

• 作者: 夏志宽 敖俊红 杨蓉娅 王文岭 王聪敏 祝贺
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 毛孢子菌属 基因型 鉴定
• 年，卷（期）: 2008,（44）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 3145-3148
• 页数: 4页
• 分类号: R3
• 字数: 2728字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0376-2491.2008.44.014

摘要

目的 比较不同DNA区域在毛孢子菌分子学鉴定方面的灵敏性和特异性以及国内临床分离5株阿萨希毛孢子菌(T. Asahii)基因型的研究.方法 用玻璃珠法提取总DNA,用D1/D2(26s)、ITS、IGS1区的特异性引物进行PCR扩增,克隆、测序;用CLUSTAL X 1.83进行比对分析,构建系统发生树并进行基因分型.结果 T. Asahii(CBS2479)、真皮毛孢子菌(T. Dermatis)、赖巴克斯毛孢子菌(T. Laibachii)3株菌D1/D2长度分别为:640、639、637 bp;ITS区长度分别为:541、528、531 bp;IGS1区长度分别为:643、515、411 bp.临床分离5株T. Asahii IGS1区长度均为643 bp.所有毛孢子菌D1/D2区序列相似性为:89%～99%,ITS区为85%～99%,IGS1区为11%～95%.临床分离菌株BZP07001,BZP07002,BZP07004,BZP07005属于基因型Ⅰ,菌株BZP07003属于基因型Ⅳ.结论 在鉴别系统发生关系较近的毛孢子菌时IGS1区序列分析优于D1/D2、ITS区,IGS1区序列分析具有更高的灵敏性和特异性.国内临床分离5株T. Asahii分属基因型Ⅰ和Ⅳ.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨蓉娅	北京军区总医院皮肤科	293	1410	15.0	25.0
2	王文岭	北京军区总医院皮肤科	113	437	9.0	16.0
3	王聪敏	北京军区总医院皮肤科	109	506	12.0	15.0
4	敖俊红	北京军区总医院皮肤科	73	421	8.0	17.0
5	夏志宽	北京军区总医院皮肤科	34	107	6.0	7.0
6	祝贺	北京军区总医院皮肤科	19	79	6.0	7.0