甘蓝型油菜'沪油15'中两个CBF类转录因子的克隆与分析

• 作者: 乔玉山 姚泉洪 庄静 彭日荷 朱波 熊爱生 章镇 金晓芬
• 来源期刊: 植物生理学通讯
• 学科: 农学
• 关键词: 转录因子 CBF 生物信息学 甘蓝型油菜'沪油15'
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1106-1112
• 页数: 7页
• 分类号: S6
• 字数: 3144字
• 语种: 中文

摘要

以拟南芥CBF家族转录因子AP2保守域的氨基酸序列为信息探针,搜索油菜uniGene数据库,得到2个UniGene:Bna.2193和Bna.2260,序列拼接得到2个cDNA序q(BnaCBF-1和BnaCBF-2).通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型油菜‘沪油15'的DNA和cDNA中克隆了上述基因.序列分析显示,克隆的BnaCBF-1-Hy15与BnaCBF-1基因序列完全一样,而BnaCBF-2-Hy15与BnaCBF-2的基因序列差异很小,只有4个氨基酸位点不同,且都没有内含子.从cDNA序列,氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、序列比对、进化树、功能域、二级结构、三级结构进行了预测.结果显示,'沪油15'来源的BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15转录因子属于AP2/ERF家族中的DREB-A1亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与atCBF1相似.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章镇	南京农业大学园艺学院	286	5756	35.0	58.0
2	乔玉山	南京农业大学园艺学院	82	1302	22.0	33.0
3	庄静	南京农业大学园艺学院	21	210	7.0	14.0
5	姚泉洪		62	1232	19.0	33.0
6	彭日荷	上海市农业科学院生物技术研究所	39	473	13.0	21.0
7	熊爱生	上海市农业科学院生物技术研究所	32	471	13.0	20.0
10	朱波	上海市农业科学院生物技术研究所	4	31	3.0	4.0
11	金晓芬	上海市农业科学院生物技术研究所	4	43	4.0	4.0