分子动力学并行算法的优化与应用

• 作者: 刘正华 杨决宽 陈云飞
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 分子动力学 并行算法 原子分解法 MPI_Allgather 邻居交换算法 非阻塞通信
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 718-720
• 页数: 3页
• 分类号: TP3|TP301.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2008.03.021

摘要

比较了小型机群中模拟小规模粒子系统采用原子分解和区域分解算法的模拟时间.针对原子分解算法,优化了各进程粒子的受力计算,尤其对严重影响并行效率的全局通信进行了优化,最终使得并行效率提高了30%以上.使用该优化算法对固态氩的导热系数进行了计算,模拟结果与实验值比较吻合,大大缩短了时间.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘正华	东南大学机械工程学院	2	21	2.0	2.0
2	杨决宽	东南大学机械工程学院	27	150	9.0	11.0