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等电聚焦分离与18O稳定同位素标记联用的磷酸化蛋白质组学定量方法研究
等电聚焦分离与18O稳定同位素标记联用的磷酸化蛋白质组学定量方法研究
作者:
刘金风
卢庄
宋丽娜
王京兰
蔡耘
贾伟
钱小红
隋少卉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
18O标记技术
等电聚焦
傅里叶交换离子回旋质谱(LTQ-FTICR-MS)
磷酸化蛋白质组定性与定量
摘要:
磷酸化蛋白质组学定量分析,要对磷酸化修饰富集技术和定量技术进行研究.基于此,本研究采用18O稳定同位素标记技术对胰蛋白酶酶解肽段混合物进行标记, 并对其标记时间和标记后胰蛋白酶的变性条件进行优化.结果表明:在pH=4~5的KH2PO4缓冲体系中,37 ℃,标记反应持续19~24 h,除了C-端肽之外,几乎所有的肽段都可达到100%标记;采用TCEP可以有效地抑制16O-18O回标现象.建立了与18O标记技术兼容性良好的IPG-IEF技术对磷酸化肽段进行选择性富集,富集后共从HepG2细胞中鉴定到491个磷酸化位点、362个磷酸化肽段和356个磷酸化蛋白,表明IPG-IEF在大规模磷酸化肽段分离富集中是有效的;最后与高准确度高灵敏度高分辨率的LTQ-FTICR质谱仪联用,建立了基于18O-IPG-IEF-LTQ-FTICR的磷酸化蛋白质组定量技术.实验结果表明,该技术可以实现磷酸化肽段的有效定性和定量.本研究为磷酸化蛋白质组学定量研究提供了实用技术.
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文献信息
篇名
等电聚焦分离与18O稳定同位素标记联用的磷酸化蛋白质组学定量方法研究
来源期刊
分析化学
学科
化学
关键词
18O标记技术
等电聚焦
傅里叶交换离子回旋质谱(LTQ-FTICR-MS)
磷酸化蛋白质组定性与定量
年,卷(期)
2008,(8)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1017-1023
页数
7页
分类号
O6
字数
4390字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:0253-3820.2008.08.002
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
(0)
参考文献
(1)
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2015(1)
引证文献(1)
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研究主题发展历程
节点文献
18O标记技术
等电聚焦
傅里叶交换离子回旋质谱(LTQ-FTICR-MS)
磷酸化蛋白质组定性与定量
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
分析化学
主办单位:
中国化学会
中国科学院长春应用化学研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0253-3820
CN:
22-1125/O6
开本:
大16开
出版地:
长春人民大街5625号
邮发代号:
12-6
创刊时间:
1972
语种:
chi
出版文献量(篇)
9636
总下载数(次)
16
总被引数(次)
112365
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
国家重点基础研究发展计划(973计划)
英文译名:
National Basic Research Program of China
官方网址:
http://www.973.gov.cn/
项目类型:
学科类型:
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