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硝尔库勒湖沉积物中非培养放线菌多样性
硝尔库勒湖沉积物中非培养放线菌多样性
作者:
关统伟
吴晋元
吴晓阳
唐蜀昆
张利莉
徐丽华
李文均
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
硝尔库勒湖
系统发育
放线菌多样性
免培养方法
摘要:
[目的]认识和了解盐湖沉积环境中放线菌的多样性,为今后的开发和利用奠定基础.[方法]应用免培养技术和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对新疆硝尔库勒盐湖沉积物中放线菌的多样性进行了研究.实验采用SDS-CTAB法提取土样中总DNA,利用放线菌特异性引物对土样总DNA进行16S rRNA基因扩增,并构建16S IRNA基因克隆文库;对随机挑选的160个克隆通过酶切筛选出51个不同图谱的重组克隆,并对其测序.[结果]所获得的51个克隆序列属于39个OTUs,其中52.9%的克隆序列分布于放线菌门(phylum Actinobacteria)放线菌亚(Actinobacteridae)的5个亚目和酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)中,并且在这两个亚纲中有大量克隆序列属于放线菌的新类群,另外47.1%的克隆序列以极高的自展值在放线菌门内支持形成一个独立的大分支,极有可能代表一个新亚目或更高级分类单元的类群.[结论]这些研究结果说明硝尔库勒盐湖中存在有较为丰富的放线菌系统发育多样性,并且潜藏着新类型的放线菌资源.
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台湾海峡海洋沉积物放线菌的多样性
海洋
放线菌
多样性
系统发育
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
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相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
硝尔库勒湖沉积物中非培养放线菌多样性
来源期刊
微生物学报
学科
生物学
关键词
硝尔库勒湖
系统发育
放线菌多样性
免培养方法
年,卷(期)
2008,(7)
所属期刊栏目
分类和进化
研究方向
页码范围
851-856
页数
6页
分类号
Q939
字数
4215字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:0001-6209.2008.07.002
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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系统发育
放线菌多样性
免培养方法
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
微生物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0001-6209
CN:
11-1995/Q
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号中科院微生物所内
邮发代号:
2-504
创刊时间:
1953
语种:
chi
出版文献量(篇)
4459
总下载数(次)
15
总被引数(次)
53416
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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