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油菜油体钙蛋白基因BnClol的克隆和表达
油菜油体钙蛋白基因BnClol的克隆和表达
作者:
丁勇
常玮
徐春雷
甘莉
陈庆波
原文服务方:
作物学报
油体钙蛋白:RACE
基因克隆
同源简并引物
序列分析
Northern杂交
摘要:
应用同源序列克隆法设计同源简并引物,结合RT-PCR和RACE-PCR技术.从甘蓝型油菜中分离克隆了编码28.1 kD油体钙蛋白(caleosin)的基因BnClol.其全长1 058 bp的BnClol mRNA(GenBank中序列号为AY966447)包含完整的开放阅读框和3'末端Poly(A)尾巴结构,染色体DNA结构上含6个外显子和5个内含子.Northern杂交结果表明,油菜中BnClol在种子形成中期开始丰富表达,在种子形成后期,即种子开始脱水成熟时期,高量稳定地表达.半定量PCR结果显示,BnClol在油菜种子吸水膨胀后前2d的茎中明显表达.证明在油菜种子发育期间,BnClol对mRNA的转录表达是由胚胎发育来调控的.具有显著的时空特性,并与油体的形成和积累密切有关.推测的caleosin蛋白为245个氨基酸残基(GenBank中序列号为AAY40837)组成的两性蛋白质,主要含3个结构域即由N末端1~16位氨基酸残基组成的a-螺旋和17-61位氨基酸残基组成的强亲水性的随机卷曲构成的N-末端亲水性结构域;由80-120位氨基酸残基组成的中间疏水性结构域和C-末端亲水性结构域.N-末端亲水性结构域包含一个潜在的结合Ca2+的EF-手结构.中间疏水性结构域包含一个潜在的脯氨酸-结(proline-knot)模体,在92~114位氨基酸残基组成的a-螺旋跨膜区域,推测在caleosin蛋白与单层磷脂层和油体锚定结合上及增加种子油体的稳定性上起着重要的作用.
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内容分析
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文献信息
篇名
油菜油体钙蛋白基因BnClol的克隆和表达
来源期刊
作物学报
学科
关键词
油体钙蛋白:RACE
基因克隆
同源简并引物
序列分析
Northern杂交
年,卷(期)
2008,(11)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
研究方向
页码范围
1921-1928
页数
8页
分类号
S5
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2008.01921
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
丁勇
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
3
59
3.0
3.0
5
陈庆波
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
1
11
1.0
1.0
6
徐春雷
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
3
55
3.0
3.0
7
常玮
中国科学院昆明植物研究所
9
47
5.0
6.0
8
甘莉
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
16
341
11.0
16.0
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
全文
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引文网络
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(31)
共引文献
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参考文献
(17)
节点文献
引证文献
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同被引文献
(38)
二级引证文献
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基因克隆
同源简并引物
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Northern杂交
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
总被引数(次)
197718
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
期刊文献
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