基于EST库的猕猴桃脂氧合酶基因家族成员的克隆

• 作者: 张波 李鲜 陈昆松
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猕猴桃 脂氧合酶 LOX基因家族 EST 克隆
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 337-342
• 页数: 6页
• 分类号: S663.4
• 字数: 3745字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0513-353X.2008.03.004

摘要

利用猕猴桃EST库及相关生物信息学手段,从果肉组织克隆了LOX基因家族成员6个,命名为AdLox1-6.AdLox1、AdLox2、AdLox3和AdLox4为全长cDNA,编码区长度分别为2 739、2 595、2 739和2 709 bp,AdLox5和AdLox6为cDNA片段,长度为1 359和1 557 bp.猕猴桃AdLox2和AdLox5氨基酸序列同源性最高,约74%,而AdLox3和AdLox5仅为49%.生物信息学分析表明,AdLox1、AdLox3、AdLox4和AdLox6可能具有13-LOX活性,在N端含有额外约60个氨基酸残基,而AdLox2和AdLox5则属于9-LOX类型.猕猴桃AdLox1与番茄TomLoxD具有最高氨基酸序列同源性(约80%),AdLox2和AdLox5与TomLoxA高度聚类,序列同源性分别为68%和75%,AdLox4和AdLox6与TomLoxC的氨基酸序列同源性分别为62%和63%,AdLox3与番茄LOX基因序列同源性低于55%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈昆松	浙江大学果实分子生理与生物技术实验室农业部园艺植物生长发育与生物技术重点开放实验室	62	2676	27.0	51.0
2	李鲜	浙江大学果实分子生理与生物技术实验室农业部园艺植物生长发育与生物技术重点开放实验室	18	416	9.0	18.0
3	张波	浙江大学果实分子生理与生物技术实验室农业部园艺植物生长发育与生物技术重点开放实验室	43	470	10.0	21.0