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狐貉源犬瘟热病毒融合蛋白基因的同源性分析
狐貉源犬瘟热病毒融合蛋白基因的同源性分析
作者:
刘澜澜
华育平
张莉
曾祥伟
原文服务方:
东北林业大学学报
犬瘟热病毒
F基因
基因克隆
同源性分析
摘要:
2004-2006年,从黑龙江省和内蒙等地发病饲养狐、貉中分离获得6株犬瘟热病毒(CDV),分别命名为MS01、SC01、ZD01、GN01、HL01、NM01分离株.根据Genbank上发表的的CDV F基因序列设计了1对特异性引物,应用RT-PCR方法分别对6个分离株F基因进行克隆、测序,并推导其氨基酸序列,绘制出F基因的遗传进化树.结果表明:6个CDV分离株F基因的开放阅读框架(ORF)均为1989bp,编码663个氨基酸,蛋白结构中的13个Cys残基位点和4个潜在的糖基化位点均高度保守,其裂解位点的氨基酸序列为220R-R-Q-R-224R.遗传进化分析表明:6个分离株与CDV代表强毒株A75/17属于同一谱系,均为强毒株.其中,HL01株与海豹瘟热病毒2型(PDV-2)亲缘关系较近,与其它5个分离株关系相对较远.
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文献信息
篇名
狐貉源犬瘟热病毒融合蛋白基因的同源性分析
来源期刊
东北林业大学学报
学科
关键词
犬瘟热病毒
F基因
基因克隆
同源性分析
年,卷(期)
2008,(3)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
70-72,77
页数
4页
分类号
S858.92
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-5382.2008.03.025
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
曾祥伟
62
246
8.0
12.0
2
华育平
91
551
12.0
17.0
3
张莉
48
143
5.0
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4
刘澜澜
3
15
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3.0
传播情况
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犬瘟热病毒
F基因
基因克隆
同源性分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
东北林业大学学报
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-5382
CN:
23-1268/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1957-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7235
总下载数(次)
0
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英文译名:
官方网址:
项目类型:
学科类型:
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