侵染甘蔗的高梁花叶病毒遗传多样性分析

• 作者: 周国辉 沈万宽 许东林 邓海华
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蔗花叶病 高粱花叶病毒 遗传分化
• 年，卷（期）: 2008,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1916-1920
• 页数: 5页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2008.01916

摘要

为探明甘蔗花叶病的病原病毒之一高粱花叶病毒(sorghum mosaic virus,SrMV)在我国华南地区的发生情况,从广东广州、翁源、博罗及广西南宁等地甘蔗产区采集表现花叶症状的甘蔗叶片样品,采用1对病毒CP基因引物(P1:5'-ACAGCAGAWGCAACRGCACAAGC-3'、P2:5'-CTCWCCGACATTCCCATCCAAGCC-3',Y=C/T,W=T/A,K=G/T,R=A/G),进行一步法RT-PCR检测,结果表明48%的样品受到SrMV侵染.根据寄主类型和地理来源,选取10份代表性样品,对经P1、P2扩增获得的病毒CP基因片段进行直接测序,所得序列经Blast比对确认均为SrMV CP序列.为揭示SrMV种内的遗传多样性,采用Clnstal W方法对本文鉴定的10个SrMV分离物与GenBank中已报道的全部18个SrMV株系或分离物的CP基因序列进行多序列联配,并计算核苷酸同一性,结果显示各个SrMV分离物之间的CP基因核苷酸同一性为76%-100%.基于病毒CP基因核苷酸同一性的遗传多样性分析,SrMV种内分化成2个遗传变异类群,即杂种甘蔗组(HS group)和高贵甘蔗组(NS group),它们的分离物大多分别来自杂种甘蔗(hybrid sugarcane)寄主和高贵甘蔗(noble sugarcane)寄主.分离物之间的平均CP基因核苷酸同一性,在两组组内分别为87%和90%,两组间为80%.说明两组SrMV之间存在较大的遗传差异,寄主隔离是导致该病毒种内分化的主要因素.因此,在甘蔗花叶病的防治和抗病毒育种工作中,除需注意病原的种类和寄主类型外,还应充分考虑病原种内的遗传多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈万宽		27	381	12.0	19.0
2	周国辉	华南农业大学植物病毒研究室	56	1146	18.0	32.0
3	邓海华		60	710	17.0	24.0
4	许东林	华南农业大学植物病毒研究室	16	222	10.0	14.0