尘螨变应原Der f1全序列的原核表达及生物信息学分析

• 作者: 周鹏 周鹰 崔玉宝 彭明 彭江龙
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 尘螨 Der f1 原核表达 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 37-43
• 页数: 7页
• 分类号: Q78
• 字数: 5648字
• 语种: 中文

摘要

目的 构建尘螨变应原Der f1原核表达体系,并了解其分子特征.方法 提取粉尘螨总RNA,用RT-PCR合成Der f1编码基因,将其克隆至pMD19-T载体,亚克隆至表达载体pET-28a(+),转化至大肠杆菌并用IPTG诱导表达.用生物信息学软件对测序结果进行分析并预测其空间结构.结果 从粉尘螨总RNA中扩增获得Der f1 cDNA片段,成功构建了表达质粒pET-28a(+)-Der f1,Western blotting显示原核表达获得成功.测序结果提交GenBank,登陆号为EU095368,该基因长966 bp,与参考序列同源性达99.9%,推测其编码氨基酸321个,属疏水蛋白,位于细胞外,信号肽位于1～18氨基酸处.同源性分析提示Der f1和Eur m1相似率为88%,而Der f1和Der p1的相似率为77%,分子进化树中粉尘螨和梅氏嗜霉螨聚成一簇.Der f1的二级结构由α-螺旋(109 aa,33.96%)、延伸链(55 aa,17.13%)、β-转角(18 aa,5.61%) 和随机卷曲(139 aa,43.30%)组成.结论 尘螨变应原Der f1原核表达获得成功,为进一步生产重组变应原奠定了基础.生物信息学分析表明粉尘螨和梅氏嗜霉螨的亲缘关系可能更近,而与屋尘螨关系稍远,此与现行的形态学分类系统并不符合.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭江龙	海南医学院寄生虫学教研室	28	93	6.0	8.0
2	彭明	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	136	1114	16.0	25.0
3	周鹏	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	129	1451	21.0	32.0
4	崔玉宝	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	25	188	9.0	13.0
6	周鹰	海南医学院寄生虫学教研室	7	31	3.0	5.0