粗糙集算法在预测RNA保守功能二级结构中的应用

• 作者: 付昊月 张祥德 薛定宇
• 来源期刊: 东北大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: RNA二级结构 粗糙集 REV应答元件 保守结构预测 HIV Rosetta
• 年，卷（期）: 2008,（10）
• 所属期刊栏目: 信息与控制
• 页码范围: 1389-1392
• 页数: 4页
• 分类号: TP391
• 字数: 2573字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-3026.2008.10.006

摘要

提出了一种预测RNA保守功能二级结构的粗糙集算法.使用粗糙集工具Rosetta软件,在保守结构预测过程的数据挖掘模块中,应用经过整理和离散化的RNA备择碱基对数据生成规则确定出将要出现在同源RNA序列的保守二级结构中的碱基对.将此算法应用在对爱滋病病原体HIV病毒RNA中REV应答元件单元的保守二级结构预测的结果表明,与传统的非数据挖掘算法相比,使用了这种机器学习算法的粗糙集预测方法,使得保守功能结构与野生型结构更加相似,重要的功能结构分支更加清晰明确.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛定宇	东北大学信息科学与工程学院	96	1470	19.0	36.0
2	张祥德	东北大学理学院	55	569	14.0	22.0