人CD44新剪接变异体克隆及分析

• 作者: 何晓松 凌月福 向秋 朱华 王建红 肖胜军 范才文 雷迅 黄岚珍
• 来源期刊: 中国病理生理杂志
• 学科: 医学
• 关键词: CD44 剪接变异体 鼻咽肿瘤
• 年，卷（期）: 2008,（9）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1734-1737
• 页数: 4页
• 分类号: R363
• 字数: 3039字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-4718.2008.09.015

摘要

目的:应用逆转录多聚酶链式反应(RT-PCR)分析CD44在鼻咽癌组织和鼻咽癌细胞株中表达,来寻找新的人CD44剪接变异体.方法:在CD44基因起始和终止密码子两端及变异剪接外显子v10中和剪接位点处设计特异性引物,以鼻咽癌组织、细胞株5-8F和HNEl eDNA为模板进行RT-PeR扩增,产物测序.然后,应用生物信息学对克隆序列进行分析.结果:新克隆的CD44剪接变异体有1634bp,包含一个完整的阅读框,起始密码子在序列的12位,终止密码子在序列的1301位,可变剪接区只有变异型剪接外显子10,预测编码429氨基酸.GenBank登陆号:EF581837.结论:一个新的、预测编码429个氨基酸的CD44剪接变异体存在于研究的人鼻咽癌组织和细胞株中,它的功能有待于进一步研究.