支持向量机及组合预测在蛋白质四级结构分类中的应用

• 作者: 周铁军 熊洁仪 王春娟 袁哲明 谭显胜
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质四级结构 分类 支持向量机 组合预测
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 646-648,637
• 页数: 4页
• 分类号: Q518-3
• 字数: 3182字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-6273.2008.04.015

摘要

目的:基于支持向量机建立一个自动化识别新肽链四级结构的方法,提高现有方法的识别精度.方法:改进4种已有的蛋白质一级序列特征值提取方法,采用线性和非线性组合预测方法建立一个有效的组合预测模型.结果:以同源二聚体及非同源二聚体为例.对4种特征值提取方法进行改进后其分类精度均提升了2～3%;进一步实施线性与非线性组合预测后,其分类精度再次提高了2～3%,使独立测试集的分类精度达到了90%以上.结论:4种特征值提取方法均较好地反应出蛋白质一级序列包含四级结构信息,组合预测方法能有效地集多种特征值提取方法优势于一体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁哲明	湖南农业大学生物安全科学技术学院	71	724	15.0	24.0
2	周铁军	湖南农业大学理学院	62	253	8.0	14.0
3	熊洁仪	湖南农业大学生物安全科学技术学院	10	73	5.0	8.0
4	谭显胜	湖南农业大学生物安全科学技术学院	18	159	7.0	12.0
8	王春娟	湖南农业大学生物安全科学技术学院	3	22	2.0	3.0