水中轮状病毒实时定量PCR外标准品的构建

• 作者: 何苗 刘丽 施汉昌 李丹 胡秀华
• 来源期刊: 环境科学
• 学科: 地球科学
• 关键词: 轮状病毒 克隆 标准品 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 页码范围: 380-385
• 页数: 6页
• 分类号: X172
• 字数: 4537字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0250-3301.2008.02.019

摘要

采用细胞培养和T-A克隆技术,在轮状病毒主要结构蛋白VP7基因序列上设计合成引物,经PCR扩增后将特异性产物连接入pGEM-T-easy载体中,经过酶切鉴定和测序分析获得轮状病毒cDNA标准品.利用常规PCR和实时定量PCR方法对所获得的cDNA标准品进行特异性、稳定性和重复性指标的检验.结果表明,利用此标准品制备的标准曲线具有较高的扩增效率和良好的线性关系(斜率为-3.353,R2=0.995);实时定量PCR熔解曲线分析表明,温度在81℃±0.5℃的PCR产物是轮状病毒VP7序列上的特异性产物,表明此标准品是轮状病毒特异性的;同时,所制备的标准品在实时定量PCR检测中具有较大的线性范围(9×100～9×1011 copies/μL,每个反应最低可以检测到9个拷贝数的轮状病毒cDNA,表明利用该标准品进行实时定量PCR分析时具有较高的检测灵敏性;此外,该标准品具有较高的稳定性和重复性(3次独立实验CV值在0.2%～0.9%之间),可长期稳定保存.构建的标准品可用作检测水环境中轮状病毒的实时荧光定量PCR的外标准品.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施汉昌	清华大学环境科学与工程系环境模拟与污染控制国家重点联合实验室	194	4507	36.0	58.0
2	何苗	清华大学环境科学与工程系环境模拟与污染控制国家重点联合实验室	82	1855	24.0	40.0
3	李丹	清华大学环境科学与工程系环境模拟与污染控制国家重点联合实验室	58	932	17.0	30.0
4	刘丽	清华大学环境科学与工程系环境模拟与污染控制国家重点联合实验室	6	62	4.0	6.0
5	胡秀华	清华大学环境科学与工程系环境模拟与污染控制国家重点联合实验室	2	36	2.0	2.0