MATLAB 7.X生物信息工具箱的应用——序列比对(二)

• 作者: 刘新星 李红燕 杨英杰 谢建平
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 工学
• 关键词: 序列比对 开放阅读框 序列散点图 同一性
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 351-353,350
• 页数: 4页
• 分类号: TP391
• 字数: 1252字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-6273.2008.02.049

摘要

序列比对是基因序列分析中的一项重要工作.本文以人和鼠的基因为对象,介绍MATLAB 7.X生物信息工具箱中的序列比对方法,内容包括从数据库获取序列信息,查找序列的开放阅读框,将核苷酸序列转换为氨基酸序列,绘制比较两氨基酸序列的散点图,用Needleman-Wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对,以及计算两序列的同一性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘新星	中南大学生物冶金教育部重点实验室	58	785	12.0	27.0
2	谢建平	中南大学生物冶金教育部重点实验室	28	228	7.0	14.0
3	杨英杰	中南大学生物冶金教育部重点实验室	27	139	7.0	11.0
4	李红燕	中南大学生物冶金教育部重点实验室	6	9	2.0	2.0