猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株非编码区及结构蛋白的生物信息学分析

• 作者: 宋振辉 张鹦俊
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪传染性胃肠炎病毒 SC-Y 非编码区 结构蛋白 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2008,（22）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 9536-9539
• 页数: 4页
• 分类号: S858.28
• 字数: 4430字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2008.22.079

摘要

利用生物软件时猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株非鳊码区及结构蛋白所含的生物学信息进行了分析.结果显示,SC-Y株与TGEV其他参考毒株(Miller M60、Miller M6、Purdue、Ptudue P115、PUR46-MAD、TS)5'UTB的二级结构差异显著.预测结构蛋白特性显示,N蛋白没有跨膜区域、糖基化位点及信号肽序列,属于非分泌性蛋白.在4种结构蛋白中,N蛋白的氨基酸变异率最低,为2.1‰.与MillerM60株、Miller M6株和TS株相比,SC-Y株S基因第1123-1128位核苷酸缺失6个碱基(AATGAT).在sM基因核苷酸第163～165位,SC-Y株比TFI株和FS772/70株多出3个碱基(ATT).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋振辉	西南大学荣昌校区动物医学系	29	132	6.0	10.0