华北典型旱地小麦土壤amoA 基因的PCR-RFLP 分析

• 作者: 史荣久 徐慧 李慧 王元芬 莫旭华 郑佳
• 来源期刊: 生态科学
• 学科: 农学
• 关键词: amoA 克隆文库 RFLP 分析 氨氧化细菌(AOB) 氨氧化古菌(AOA)
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 49-55
• 页数: 7页
• 分类号: S154.36
• 字数: 5418字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-8873.2009.01.010

摘要

通过构建氨氧化细菌(AOB )和氨氧化古菌(AOA)的氨氧化酶基因亚基A (amoA )克隆文库,并采用限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP )技术分析了华北地区典型旱地冬小麦土壤中amoA 基因的多样性.采用MspI 和AfaI 两种限制性内切酶对amoA 基因克隆文库中阳性克隆子进行双酶切后,共得到了18 个氨氧化细菌的可操作分类单元(Operational Taxa Units, OTUs )和10 个氨氧化古菌可操作分类单元(Operational Taxa Units, OTUs ),其文库覆盖率分别达到92.9%和88.3%.氨氧化细菌的Shannon-Wiener 指数、丰富度指数、均匀度指数均高于氨氧化古菌.通过对文库中amoA细菌测序分析,所有的序列都属于Nitrosospira cluster 3 .而在氨氧化古菌中存在着一个绝对优势种群,它占到克隆文库的80 %,测序分析的结果表明,氨氧化古菌属于不可培养的泉古菌门.