DNA与二脒DB293复合物的分子动力学模拟

• 作者: 张青山 马国正
• 来源期刊: 化学通报（网络版）
• 关键词: DNA DB293 动力学模拟
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 页码范围: 1-4
• 语种: 中文

摘要

采用分子动力学模拟了DNA小沟与芳香二脒化合物DB293结合形成的复合物,通过5ns的模拟研究表明,DB293分子可紧密结合在DNA的AATT小沟区域,和双螺旋d[CGCGAATTCGCG]2形成稳定的复合物.DB293中苯并咪唑环的氮原子N2能够与DNA胸腺嘧啶碱基T7的O2原子和T19的O2原子形成两个较强的氢键,同时,其末端氨基的N3原子和T20的O2原子形成一个较弱的氢键.这些结果在分子水平上提供了DB293直接与双螺旋DNA相互作用的结构及复合物的动态变化情况,为设计出更高活性的芳香二脒类DNA小沟结合剂提供一定的理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马国正	华南师范大学化学与环境学院	15	55	4.0	7.0
2	张青山	华南师范大学化学与环境学院	1	0	0.0	0.0