利用最小二乘法判断同位素标记肽的假阳性

• 作者: 刘银坤 宋培明 张扬 杨芃原 陈先 颜志国 骆建华
• 来源期刊: 上海交通大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 最小二乘法 同位素分布 比较蛋白质组 氨基酸同位素标记定量
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 15-18,24
• 页数: 5页
• 分类号: Q657.63
• 语种: 中文

摘要

提出了1种判别标记肽假阳性的方法,根据同位素分布的概率原理计算出不同标记效率下的理论同位素分布,利用最小二乘法拟合得到标记肽的标记效率,根据标记肽的假阳性阈值来判断标记肽的假阳性,并使用本方法判断了比较蛋白质组试验中的3个标记肽,结果表明,在这3个标记肽中有2个阳性标记肽结果,1个假阳性标记肽,说明此方法简单可靠,可用于判定标记肽的假阳性,衡量标记肽和正常肽之间的相似性,判断质谱峰型的变化,排除标记肽假阳性对蛋白质定量的影响.