应用巢式PCR检测鸭圆环病毒浙江株及其全基因序列分析

• 作者: 万春和 傅光华 施少华 程龙飞 陈红梅 黄瑜
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭圆环病毒 巢式PCR 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 390-395
• 页数: 6页
• 分类号: Q78|S85
• 字数: 3829字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0384.2009.05.002

摘要

应用巢式PCR(nested PCR)技术对收集自浙江温州种番鸭进行鸭圆环病毒核酸扩增,并对测定的序列进行分析,结果用套式引物扩增出目的条带片段大小约为340 nt.根据序列测定结果设计1对反向引物用于测定病毒基因组余下的基因片段.序列分析表明该圆环病毒基因组全长为1995 nt,其ORFV-1编码292个氨基酸,ORFC-1编码257个氨基酸.序列分析表明,本试验株与番鸭分离株(GenBank登录号EF451157)和半番鸭分离株(GenBank登录号EU344804)的同源性最高,均高达99.2%,与鸭圆环病毒欧洲(德国)分离株和北美(美国)分离株在同一支遗传进化关系上.