microRNA层面上癌症的公共机制

• 作者: 张绍军 李霞 肖雪
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: microRNA 癌症 富集分析
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 43-50
• 页数: 8页
• 分类号: Q74
• 语种: 中文

摘要

microRNAs(miRNA)是一类内源性的非编码小RNA.已有研究表明miRNAs的靶基因中有不少癌症的相关基因.为了全面研究miRNA与癌症的关系,作者将19种癌症的相关基因集合分别富集到494个miRNAs靶基因集合上,得到各类癌症所富集的miRNAs.结果发现19种癌症仅集中地富集在144个miRNAs上,由此验证了癌症在miRNAs上的公共机制.在此基础上,作者对癌症富集较多的8个miRNAs做了进一步研究,结果发现这8个miRNAs均为高度保守的miRNAs,且它们的靶基因集合一致富集在基因本体论(gene ontology,GO)的基本生物学过程上,并与转录因子活性以及蛋白激酶活性相关.另一方面,在基于miRNA构建的癌症网络中,前列腺癌与乳腺癌,结肠癌与乳腺癌之间共享较多的miRNAs,表明了这些癌症在miRNA层面上存在密切的关系.