沪油15中两个AP2/ERF-B1亚族转录因子的克隆与分析

• 作者: Jian Zhang 付晓燕 姚泉洪 庄静 彭日荷 朱波 熊爱生 金晓芬 高峰
• 来源期刊: 核农学报
• 学科: 农学
• 关键词: AP2/ERF B1亚族 转录因子 克隆 沪油15
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 435-441,453
• 页数: 8页
• 分类号: S6
• 语种: 中文

摘要

利用油菜EST数据库,以拟南芥ERF-B1亚族转录因子序列为探针,电子克隆拼接得到2个cDNA序列(BnaERFB1-1和BnaERFB1-2),通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型油菜沪油15的DNA和cDNA中克隆了上述基因.克隆转录因子BnaERFB1-1Hy15和BnaERFB1-2-Hy15与电子克隆的序列差异很小,分别只有2个和6个氨基酸位点不同,且都没有内含子.从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、进化树、序列比对、功能域、二级和三级结构等方面进行了分析,结果显示,BnaERFB1-1-Hy15和BnaERFB1-2-Hy15转录因子属于AP2/ERF家族中的ERF-B1亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与拟南芥atERF7相似.EST丰度分析显示,BnaERFB1-1的表达主要集中在种子中,而BnaERFB1-2的表达则主要集中在分生组织中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭日荷		39	473	13.0	21.0
2	熊爱生		32	471	13.0	20.0
3	付晓燕		6	27	2.0	5.0
4	朱波		4	31	3.0	4.0
5	金晓芬		4	43	4.0	4.0
6	高峰		8	61	5.0	7.0