鸡新城疫病毒F48E9强毒株NP基因的序列分析

• 作者: 万春和 傅光华 施少华 林建生 林芳 程龙飞 陈珍 陈红梅 黄瑜
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡新城疫病毒 F48E9株 NP基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 385-389
• 页数: 5页
• 分类号: S85
• 字数: 3370字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0384.2009.05.001

摘要

根据GenBank登录的鸡新城疫病毒NP基因序列设计引物,利用RT-PCR对F48E9强毒株NP基因进行扩增,将扩增产物经纯化后连入pMD18-T载体,通过PCR和酶切鉴定出阳性重组质粒,经测序后获得F48E9 NP基因序列.经分析发现该基因的ORF总长为1 470 bp,编码489 aa,NP蛋白有4个高度保守的Cys位点,分别位于第55、78、139、213位,且在401～440位和461～481位区域变异较大.将F48E9株与19株参考毒株的相应序列进行比较得到核苷酸序列同源性为87.9%～92.3%,氨基酸序列同源性较高,为92.2%～98.0%,遗传进化分析表明F48E9株相对独立,与参考毒株的遗传距离较远.