甜瓜EST序列中微卫星的分布特征

• 作者: 刘颖 李建吾 王兰菊 胡建斌
• 来源期刊: 植物生理学通讯
• 关键词: 甜瓜 EST序列 微卫星 特征
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 258-262
• 页数: 5页
• 语种: 中文

摘要

GenBank中35 547条甜瓜EST经去冗余处理后,得到总长度为250.3 Mb的无冗余EST 34 438条.这些序列中有2813个微卫星简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR),分布于2 107条EST中,出现频率为8.16%,平均分布距离为8.90kb.三核苷酸重复是主导重复类型,占SSR总数的47.14%;其次是二核苷酸和单核苷酸重复,分别占SSR总数的20.72%和16.99%.AAG/TTC是优势重复基元,占微卫星总数的29.26%,AG/CT和A/T分别占14.61%和16.25%.在所有的SSR中,重复次数为4～10次的占70.32%.长度为12～20 bp的占51.12%.并对这些SSR的多态性潜能进行了评价.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李建吾		44	442	12.0	19.0
2	王兰菊		34	326	13.0	16.0
3	胡建斌		59	510	12.0	20.0
4	刘颖		5	33	2.0	5.0