犬细小病毒上海分离株全基因的克隆及进化树分析

• 作者: 华修国 单同领 周雨霞 商晓桂 朱建国 杨志彪 郭伟
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 犬细小病毒 上海 2a基因亚型 进化树分析
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 病毒
• 页码范围: 27-32
• 页数: 6页
• 分类号: S858.292.265.292
• 字数: 3845字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-6422.2009.03.005

摘要

为研究上海地区犬感染细小病毒(Canine parvovirus,CPV)的基因特点和基因型,参考GenBank上细小病毒3个基因型的全基因设计6对扩增引物进行PCR,分段扩增出目标片段,克隆于T载体上,测定序列并拼接,用MEGA软件、NJ法构建进化树.结果显示,犬细小病毒全基因为4 758 bp,命名为CPV-SH,提交到GenBank上的序列号为FJ792845,与GenBank中4种基因型犬细小病毒的VP2基因核苷酸序列同源性比较发现,CPV-SH克隆与2a亚型犬细小病毒核苷酸同源性为最高99.7%,与2型、2b亚型、2c亚型的同源性分别为98.8%、99.5%、99.5%.CPV-SH属于2a亚型犬细小病毒,与国内北京分离株CPV/BJ082亲缘关系最近,同源性为99.9%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱建国	上海交通大学农业与生物学院	103	607	13.0	20.0
2	华修国	上海交通大学农业与生物学院	155	1291	18.0	27.0
3	杨志彪	上海交通大学农业与生物学院	33	184	9.0	12.0
4	郭伟	内蒙古农业大学动物医学与科学学院	26	150	7.0	11.0
6	周雨霞		27	196	9.0	13.0
9	商晓桂	内蒙古农业大学动物医学与科学学院	4	39	3.0	4.0
13	单同领	上海交通大学农业与生物学院	1	13	1.0	1.0