基于CDS..join特征域的Exon/Intron数据库的构建

• 作者: 邓小元 金鹰
• 来源期刊: 华南师范大学学报(自然科学版)
• 学科: 生物学
• 关键词: 编码序列 外显子 内含子 外显子/内含子数据库 选择性剪接
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 页码范围: 91-94
• 页数: 4页
• 分类号: Q34
• 字数: 3336字
• 语种: 中文

摘要

基因进化的研究和重构通常是在序列水平上进行的,包括比对它们的基因序列或蛋白序列.而对基因外显子/内含子结构的分析能够提供更多有价值的信息,比如绘制更为可靠的系统发生图谱,或更精确地阐明内含子的进化.为此,本文设计了相应的Perl脚本程序来提取、比较和搜索基因说明文档中CDS..join特征域的Exon/Intron结构.通过该方法,可构建相关物种的Exon/Intron数据库(EID),其主要内容包括内含子的相位,Exon或Intron的数量和大小,剪接位点的模式以及选择性剪接(Alternative splicing, AS)的相关信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	金鹰	华南师范大学信息光电子科技学院	22	146	6.0	11.0
2	邓小元	华南师范大学信息光电子科技学院	7	14	2.0	3.0