珍珠贝基于16S rRNA基因序列的亲缘关系研究

• 作者: 喻达辉 曲妮妮 郭奕惠 黄桂菊
• 来源期刊: 南方水产
• 学科: 生物学
• 关键词: 珍珠贝 16S rRNA基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 47-53
• 页数: 7页
• 分类号: Q755
• 字数: 5089字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-2227.2009.06.009

摘要

利用PCR技术分别扩增合浦珠母贝(Pinctada fucata)、长耳珠母贝(P.chemnitzi)和企鹅珍珠贝(Pteria penguin)的16S rRNA基因片段,PCR产物直接测序,删去引物及部分端部序列后,得到439 bp可供分析的核苷酸片段,用MEGA 3.1软件分析了核苷酸差异.结果表明,合浦珠母贝种内个体间序列完全相同,长耳珠母贝种内个体间有2个颠换(Transversion)突变位点,而企鹅珍珠贝种内个体间有1个转换(Transision)突变位点,5个颠换(Transversion)突变位点.与GenBank数据库中其他9种珍珠贝的序列进行比较,得到464个同源比对位点,包括51个插入/缺失位点和231个变异位点(173个简约信息位点和53个单突变子).合浦珠母贝与长耳珠母贝的同源性为83.2%,合浦珠母贝、长耳珠母贝与企鹅珍珠贝的同源性分别为55.4%和59%.NJ系统进化树表明合浦珠母贝和长耳珠母贝与珠母贝属的种类聚在一起,而企鹅珍珠贝与珍珠贝属的种类聚在一起,与形态学分类一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄桂菊	农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室中国水产科学院南海水产研究所	2	20	2.0	2.0
2	喻达辉	农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室中国水产科学院南海水产研究所	3	46	3.0	3.0
3	郭奕惠	农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室中国水产科学院南海水产研究所	1	11	1.0	1.0
4	曲妮妮	农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室中国水产科学院南海水产研究所	1	11	1.0	1.0