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摘要:
利用基于经典HP模型的蛋白质序列混沌游走方法(chaos game representation,CGR),给出了RHD基因的蛋白质序列CGR图,可视作蛋白质序列二级结构的一个特征图谱描述,对临床上的血型鉴别有一定的参考价值.另外,还根据由Jeffrey在1990年提出的描绘DNA序列的CGR方法,给出了RHD基因的DNA序列的CGR图,并且根据RHD基因DNA序列的CGR图算出了RHD基因相应的马尔可夫两步转移概率矩阵.从概率矩阵表可以看出RHD基因对编码氨基酸的三联子的第3个碱基的使用偏好性.
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文献信息
篇名 基于混沌游走方法的Rh血型系统中RHD基因的分析
来源期刊 生命科学研究 学科 医学
关键词 混沌游走方法 RHD基因 经典HP模型 马尔可夫模型 概率矩阵
年,卷(期) 2009,(5) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 408-412
页数 5页 分类号 O15|TP391|Q617|R33
字数 4154字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 齐斌 无锡职业技术学院基础部 14 40 5.0 6.0
2 朱平 江南大学理学院 60 186 7.0 12.0
3 高雷 江南大学理学院 8 53 5.0 7.0
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研究主题发展历程
节点文献
混沌游走方法
RHD基因
经典HP模型
马尔可夫模型
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期刊影响力
生命科学研究
双月刊
1007-7847
43-1266/Q
大16开
湖南省长沙市湖南师范大学生命科学院
42-172
1997
chi
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