新城疫病毒分离株F基因的克隆与序列分析

• 作者: 成进 李延涛 柏庆 汪萍 袁萍 闫丽辉
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 新城疫病毒 F基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 50-54
• 页数: 5页
• 分类号: S852.65|Q785
• 字数: 3648字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2009.03.013

摘要

应用RT-PCR分别扩增出新城疫病毒(NDV)青海株(QH3)、黑龙江株(HLJ)和甘肃株(A4)的融合蛋白(F)基因的全长核苷酸,再克隆到pMD18-T载体中.经酶切和质粒PCR鉴定,获得阳性重组质粒后,进行序列测定并推导出其氨基酸序列,同时进行分析和比较.序列分析结果表明,所获得的3个分离株F基因完整的开放阅读框长度为1 662 bp,共编码F蛋白的553个氨基酸;3个毒株之间的核苷酸序列同源性为88.0%～90.6%;与常用疫苗株之间核苷酸序列同源性只有85.3%～91.6%.三者F基因的裂解位点均为112R-R-Q-K/R-R-F117,符合强毒株裂解区氨基酸组成的特征.以1 bp～374 bp的核苷酸序列绘制系统发育树分析表明,QH3株NDV为基因Ⅷ型,A4株NDV为基因Ⅵ型,HLJ株NDV为基因Ⅸ型.