杯果木CCR基因克隆和同源进化分析

• 作者: 陈碧华
• 来源期刊: 桉树科技
• 学科: 农学
• 关键词: 粗毛杯果木 软叶杯果木 CCR基因 基因克隆 同源性 分子进化
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 7-12
• 页数: 6页
• 分类号: S792.39
• 字数: 4886字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-3172.2009.01.002

摘要

从粗毛杯果木和软叶杯果木基因组中克隆CCR基因,经测序验证扩增片断长度均为2321 bp,包含部分外显子3、4和部分5,以及内含子3和4.同源性比较分析表明:租毛杯果木与伞房属树种CCR的同源相似性达到98%～87%,与桉属树种CCR的同源相似性达到97%～84%;而软叶杯果木与伞房属树种CCR的同源相似性达到98%～87%,与桉属树种CCR的同源相似性达到95%～84%.总体上,该2个杯果木树种与伞房属CCR同源相似性较高,而与桉属CCR同源相似性较低.3个属中最长保守序列位于Exon5的第3147～3175位点,共29个碱基.保守区域主要集中于Exon 5,少数于Intron4.桉属总变异率大于杯果木属和伞房属.桉属Exon 4变异率大于属内其它Exon或Intron;同样发现Exon 4的简约信息位点百分数大于属内其它Exon或Intron,但杯果木属中的Intron 3变异率高于属内其它Exon或Intron.伞房属以Exon 5的变异率最高.Exon或Intron平均变异率均以桉属最多,其次是杯果木属,最少的是伞房属.使用MEGA3.1软件构建的CCR进化树表明,桉属、伞房属和杯果木属分别形成单系,其亲缘关系可以明显区分开来.杯果木属最早产生分歧,并形成单独一个分枝;其次是伞房属,也形成单独-个分枝,进化较杯果木属迟;最迟进化的是桉属,也形成单独一个分枝.这种结果与形态学比较接近,易为人们所接受.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈碧华		28	224	9.0	13.0