结直肠癌患者粪便细菌DNA提取方法的比较研究

• 作者: 包维民 王昆华 邵剑春 郭世奎 陈第 龚昆梅
• 来源期刊: 云南医药
• 学科: 医学
• 关键词: 结直肠癌 粪便 细菌 DNA提取
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 520-523
• 页数: 4页
• 分类号: R735.3+4
• 语种: 中文

摘要

目的 比较结直肠癌患者粪便细菌DNA提取方法的优缺点及获得DNA的质与量,有利于结直肠癌患者肠道相关分子微生态的研究.方法 采用传统法,化学裂解法和TIANamp bacteria DNA Kit试剂盒法,提取粪便中细菌DNA,比较其作为模板,用于细菌16S rRNA基因PCR扩增后凝胶电泳的优缺点及用核酸蛋白检测仪Biophotmeter测定提取DNA的质与量.结果 传统法提取DNA的量及纯度均较低(22.37士2.45,3.24±O.22),化学裂解法和试剂盒方法提取的量及纯度均较高,(分别为33.87±2.06,2.18±0.44;38.60±9.00,1.70±0.09);传统法与化学裂解法、试剂盒法相比差异有统计学意义(P<O.05),化学裂解法与试剂盒法相比差异无统计学意义(P>0.05),但以试剂盒法为佳.结论 3种方法各具优缺点,不同的DNA提取方法会影响结直肠癌患者肠道相关分子微生态的研究结果.与传统法和化学裂解法比较,试剂盒提取法的效率更高,能够检测到更多种类的细菌,更合适肠道相关分子微生态的研究.