浙江三门湾日本蟳群体线粒体16SrRNA基因序列多态性

• 作者: 张永 徐兆礼 沈盎绿 赵云龙 马凌波 马春艳
• 来源期刊: 海洋渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 日本蟳 线粒体 16SrRNA 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 134-138
• 页数: 5页
• 分类号: Q953
• 字数: 2549字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-2490.2009.02.004

摘要

采用聚合酶链式反应(PCR)技术对浙江三门野生日本蟳20个个体的mtDNA 16SrRNA基因进行扩增,PCR产物经纯化后进行测序,得到495 bp的核苷酸序列片段.测序结果经比对校正后,获得三群体16SrRNA基因一致序列,片断长为495 bp,其中变异位点15个,简约位点11个,总变异为3.03%.在测得的495 bp目的DNA片段中,碱基T、C、A、G平均组成分别为35.2%、17.9%、35.3%和 11.6%,其A+T含量(70.5%)远高于G+C含量(29.5%).在20个个体中共检测到7个单倍型,单倍型多样性为0.642,核苷酸多样性为0.448%.根据Kimura遗传距离的计算结果,各单倍型之间的遗传距离为0.2%~2.68%.16SrRNA构建的NJ系统发育树表明,梭子蟹属的远洋梭子蟹和青蟹属的拟穴青蟹亲缘关系较近,与蟳属的日本蟳亲缘关系较远,与形态和RAPD研究结果一致.