甘蔗杆状病毒基因组片段整合入杂种甘蔗基因组的证据

• 作者: 周国辉 蔡艳清 许东林
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘蔗杆状病毒 杂种甘蔗 病毒同源序列 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 19-23
• 页数: 5页
• 分类号: Q939.46
• 字数: 4595字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-411X.2009.04.005

摘要

为研究甘蔗杆状病毒Sugarcane bacilliform virus(SCBV)的基因组片段是否整合进杂种甘蔗Saccharum inter-specific hybrids基因组,以采自广西甘蔗研究所的1株杂种甘蔗植株叶片总DNA为模板,根据已报道的甘蔗杆状病毒基因组序列设计多条特异引物.经PCR扩增、产物克隆及序列分析,获得1个全长为5 364 bp的核苷酸序列.该序列具有SCBV基因组结构特征,含有2个完整的ORF,与GenBank中已报道的2个SCBV分离物之间的核苷酸及氨基酸序列同一性均大于70%,但该序列与完整的SCBV基因组全序列相比,不具备完全的ORF3,缺失了对病毒复制过程极为重要的功能性基因RNase H的序列区段.通过Southern-blot杂交分析,初步推测其为一段整合入杂种甘蔗基因组中的SCBV基因组序列.