梨火疫病病原菌(Erwinia amylovora)三型分泌系统的鉴别及Erwinia spp. HrpA的分析

• 作者: 怀雁 朱勃 谢关林 金谷雷
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 梨火疫病 三型分泌系统 HrpA 正向选择 净化选择
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 505-510
• 页数: 6页
• 分类号: S4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.02.016

摘要

[目的]明确梨火疫病病原菌(Erwinia amylovora)三型分泌系统(type Ⅲ secretion system,TTSS)的所在区域、相关基因及Erwiaia spp.的HrpA(hypersensitive response and pathogenicity gene A)选择压水平.[方法]利用生物信息学方法,通过BLAST程序对梨火疫病菌基因组的核苷酸数据库进行同源比对,同时对Erwiaia spp.与宿主互作的表面蛋白HrpA进行选择压分析.[结果] TTSS分析结果显示在40 kb大小的毒力岛上有27个TTSS相关基因.通过与看家基因及毒力岛上的致病性相关的重要基因HrpN的比较、选择压分析、多序列比较,发现HrpA基因处于较强的选择压作用下,且HrpA蛋白N端主要受正向选择,C端主要受净化选择.NJ法构建的HrpA系统发育树显示Erwinia spp.形成两个明显的分支,表明HrpA基因可能在种间分化后产生了不同的选择压变化.[结论]梨火疫病病原菌基因组3.14-3.18 Mb为其TTSS分布区域.该病原菌通过TTSS侵染寄主植物,在其病原菌表面有一种类鞭毛结构的TTSS蛋白HrpA,HrpA作为传输者起着将效应分子输送到宿主内部的功能,在进化上受到了较强的选择压影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢关林	浙江大学生物技术研究所	61	1191	21.0	33.0
2	金谷雷	浙江大学生物信息学研究所	3	20	2.0	3.0
3	朱勃	浙江大学生物技术研究所	1	2	1.0	1.0
4	怀雁	浙江大学生物技术研究所	1	2	1.0	1.0