斜带石斑鱼脂肪酸去饱和酶和延长酶基因全长cDNA序列的克隆与分析

• 作者: 何珊 李观贵 梁旭方 程龙球 郁颖 陈晓艳 黄柏炎
• 来源期刊: 热带海洋学报
• 关键词: 脂肪酸去饱和酶 脂肪酸延长酶 基因克隆 斜带石斑鱼 Epinephelus coioides
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 海洋生物学
• 页码范围: 95-102
• 页数: 8页
• 分类号: P735.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5470.2009.06.013

摘要

利用逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)和cDNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)方法获得斜带石斑鱼Epinephelus coioides肝脏中控制高不饱和脂肪酸合成的脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase,FAD)和脂肪酸延长酶(fatty acid elongase,ELO)基因的全长cDNA序列.结果表明,FAD基因的全长cDNA序列长1979 bp.含1338 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码445个氨基酸.编码的蛋白序列含有FAD全部的特征结构区,包括3个组氨酸簇、2个跨膜区和1个细胞色素b5结构域,与金头鲷Sparus aurata、大麻哈鱼Oncorhynchus keta、鲤鱼Cyprinus carpio和斑马鱼Danio rerio FAD的氨基酸同源性为66.5%-90.8%.二级结构分析显示其以螺旋和β折叠为主,系统进化分析表明其与金头鲷和欧洲鲈鱼的亲缘关系最近.ELO基因的全长cDNA序列1228 bp,含有885 bp的开放阅读框,编码294个氨基酸.该蛋白序列含有单一的氧化还原中心组氨酸簇、内质网停留信号和多个跨膜区等ELO特征结构区,与金头鲷、大麻哈鱼、尼罗罗非鱼Oreochromis niloticus和斑马鱼ELO的氨基酸同源性为71.1%-85.7%.蛋白二级结构预测表明其含有丰富的螺旋和β折叠结构,系统树分析显示其与金头鲷亲缘关系最近.斜带石斑鱼FAD和ELO全长cDNA序列的获得,为今后进一步研究其高不饱和脂肪酸合成途径奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁旭方	暨南大学生命科学技术学院	96	622	13.0	17.0
2	李观贵	暨南大学生命科学技术学院	13	62	6.0	7.0
3	何珊	暨南大学生命科学技术学院	8	34	3.0	5.0
4	郁颖	暨南大学生命科学技术学院	6	36	5.0	6.0
5	陈晓艳	暨南大学生命科学技术学院	13	124	8.0	11.0
6	黄柏炎	暨南大学生命科学技术学院	12	109	6.0	10.0
7	程龙球	暨南大学生命科学技术学院	14	91	6.0	9.0