鸭瘟病毒UL24基因的分子特征分析

• 作者: 信洪一 朱德康 汪铭书 程安春 葛菡 贾仁勇 陈孝跃 齐雪峰
• 来源期刊: 中国兽医科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭瘟病毒 UL24基因 分子特征 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 病原生物学
• 页码范围: 110-118
• 页数: 9页
• 分类号: S852.659.1
• 字数: 6639字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4696.2009.02.004

摘要

根据本实验室获得的鸭瘟病毒的一段基因序列设计引物,利用PCR扩增UL24基因并克隆到pMD18-T载体,阳性重组质粒进行酶切鉴定、测序验证与生物信息学分析.结果显示,获得的UL24基因全长1 230 bp,编码409个氨基酸;与其他26株疱疹病毒科中α-疱疹病毒亚科的UL24基因的相似性较β和γ亚科高,其中与α亚科禽疱疹病毒属中的GaHV-3相似性最大(34.7%);遗传进化树显示,该基因编码的蛋白与火鸡疱疹病毒的UL24蛋白的亲缘性最近.该蛋白是一种保守但不舍信号肽的外膜蛋白,具有5个潜在的N-糖基化位点和19个磷酸化位点;编码的氨基酸Ala,Apn,Glu,Phe,Leu,Arg,Thr,Val具有一定的偏嗜性.二级结构分析显示,α螺旋和无规卷曲含量高,均达46.94%,而β折叠仅占6.11%;同源建模比对,未发现与之匹配的三级结构;预测的抗原表位主要位于肽链第36～48、241～323、344～379位区段.